天启后期毛文龙的不法行为逐渐传闻于明廷，不过因为毛文龙贿赂权贵，勾结阉党，在朝廷有了靠山，因而毛文龙不仅得以压制反对的言论，而且屡受恩宠，请饷百万的诉求也得到熹宗的依允，可谓一时得意。
然而，熹宗的死、魏忠贤与阉党的倒台，宣示着朝廷政局的大变动。
崇祯成为新帝后，经过一段时间的筹备，开始大规模地惩治阉党，昭雪冤狱，起用正人，为魏忠贤和阉党搅得混浊不堪的朝廷终于气象一新了。
这是崇祯在政治上的维新之治。
面对着更加严峻的辽东形势，清除阉党在边镇的势力，釐革天启后期宦官典兵、冒赏滥萌等弊政，起用有威望、有才能的将帅督抚，这成为崇祯初维新之政的又一重要内容。
崇祯初言路大开，毛文龙作为名副其实的阉党，又有着诸多不法行为，没了阉党的庇护，“人始敢言东江”，成为舆论的攻击对象是很自然的事。
崇祯元年正月二十四日，原登莱巡抚武之望奏“岛帅欺罔尽露事”，奉圣旨
“毛文龙拥布海外，岁糜重饷，着即奋力恢辽，以慰东顾，余勿苟求，移师盖套，还宜商酌行，已有旨了”。（《圣朝新政要略》卷6）
武之望章奏不见史籍，但据同年三月毛文龙辨疏则称有“通奴”、“贪财”、“好色”数款，所谓通奴是指天启后期毛文龙与李永芳往来之事，贪财是指“侵帑金、钦赏入己”，好色是指毛文龙等东江将帅在军中多蓄妻妾。
应该说，武之望指毛文龙贪财、好色确是有据，但是诬其天启后期通敌则为过疑。
二月十九工科右给事中潘士闻弹劾毛文龙
崇祯初年裁革东江军镇军饷始末——“惟是总(1/18)