当皇太极收到袁崇焕要求归还辽东土地、人民的回信，又得知明廷内部反对议和的声音很强大，他就对议和不抱希望，决意对明发动报复性的战争。
崇祯二年六月，皇太极下谕诸贝勒大臣“从前遣白喇嘛向明议和，明之君臣，若听朕言，克成和好，共享太平，则我国满汉蒙古人等，当釆参开矿，与之交易。若彼不愿太平，而乐于用兵，不与我国议和，以通交易，则我国所少者不过锻帛等物耳。我国果竭力耕织，以裕衣食之源，即不得锻帛等物，亦何伤哉。我屡欲和而彼不从，我岂可坐待，定当整旅西征。师行时，勿似先日以我兵独往，当令蒙古科尔沁、柯尔克、扎鲁特、敖汉、柰曼诸国合师并举”。
七月十六他致书大明国诸臣，对明朝大加斥责，威胁发动战争来报复，这其实就是发出了“己巳之变”的战争宣言。
己巳之役，后金兵之所以能绕过重兵驻守的宁锦防线取道蒙古入犯蓟边，很重要的原因是碦喇沁蒙古的降金并充当后金向导。
启祯之交，漠南蒙古形势发生了巨大变化。
首先是察哈尔林丹汗下属敖汉部、奈曼部因与大汗结怨，又怕后金来攻，遂归降后金，以此引起了山南察哈尔其他部落的纷纷不安，要么选择远避，要么选择投降后金。
敖汉部、奈曼部离开宁远、锦州边外的住牧地，东投后金，使得宁、锦防线北边的屏障渐稀，其侧翼的防护作用受到削弱。正如王之臣所说，“西虎自都令等东投奴贼，北边行六七日，閬无一夷，则我之肩背皆受敌之地也”。
其次，更严重的是察哈尔本部林丹汗西迁，与右翼蒙古各部争战，这给当时辽东的军事形势造
浅析己巳之变的实际起因——驳一个根深蒂固(10/12)