险地，为百姓治病，探究疫病治疗和预防办法。年老之后，他回到家族，写下《疫病论》这一传世巨作。在这部书中，他对当时发生过的鼠疫、天花、伤寒，都有详细的描述，并提出了治疗和预防的方法。特别是预防的方法，和后世已经十分接近。
邓东阳也是华国乃至世界上第一个提出可以接种天花豆痂粉末来预防天花的人。虽然他当时提出的是人痘接种，并不知道牛痘也可以接种，且安全性更高。但这已经是巨大进步。
这个时代欧洲也有黑死病。当黑死病爆发平息近百年后，中西方文明还是交流，当西方某著名医学家看到《疫病论》这部书之后，忍不住失声痛哭。那医学家祖父母一辈有不少死在黑死病中，他言，如果那时候《疫病论》已经传到欧洲，能拯救欧洲千万人口。