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对于甘肃镇现有的大量士兵，李自成早就盘算过了，一旦占领了整个甘肃镇，李自成准备开始新一轮的扩军，甘肃镇能给西宁军提供大量的粮食，而且地盘也是大大增加，与朝廷决战的风险越来越大，扩军实在必行。
新一期的扩军，李自成计划将现在参与作战的三个百户，扩充至千人以上，真正的千户编制，三名百户官也将升职为从千户；另外，驻守北川县的秦大年的第三百户，目前只有六个总旗，三百余士兵，这一次至少要扩充到十个总旗，五百人以上。
此外，李自成准备将自己的亲兵，扩充到五十六人，一个总旗的编制，何小米也将成为真正的亲兵总旗官。
这样扩充以后，西宁军传统的七大百户，将有三个百户达到千余士兵，四个百户达到五百人以上，总兵力超过五千，基本上是大明立国初年一个卫的编制。