疫之初，官府也做了一些防疫工作。但设备落后、缺乏科学知识和有效的防疫手段，使得这些努力在汹涌的疫情面前无异于杯水车薪。
1909年12月初，外务部右丞施肇基收到了罗倭两国的照会，罗刹国和倭国以后金政府无力控制疫情为名，要求独立主持北金防疫事宜。
自从1895年后金国在甲午海战中惨败给倭国，倭国的势力就大量涌入冥北。为了能与罗刹国结盟达到抑制倭国的目的，李鸿章与罗刹国签订了《金罗密约》，允许罗刹国在后金国领土上建筑和经理中东铁路，而罗刹方则承诺与后金国“共同防日”。但后金政府“以夷治夷”的打算落空了，很快就形成了罗倭联合侵占冥北的局面。